不動産登記のオンライン申請をした後、オンラインの方法により取得した登記識別情報（電子公文書）を登記識別情報通知（PDF）に取り込んで表示させる場合には、ブラウザ画面及び印刷結果に表示される登記識別情報の内容が、 登記申請書作成支援ソフトウェアの登記識別情報表示画面に表示している登記識別情報と一致していることを必ず確認してくださいとのことです。
（ご利用者様のソフトウェア環境等によっては、ブラウザ画面や印刷した結果に文字化け等が生じる可能性があるとのことです。ご利用環境において、正常に表示・印刷されることを確認してください。）
詳細についてはこちらをご覧ください
http://shinsei.moj.go.jp/new/new_top.html
http://houmukyoku.moj.go.jp/homu/static/olshikibetsudl_index.html